Se está impartiendo durante los bienios académicos 2003/04, 2004/05 y 2005/06, un Programa Interuniversitario de Doctorado en Derecho Tributario Europeo, programa de Doctorado que mediante Resolución de 29 de junio de 2005 de la Secretaría de Estado de Universidades e Investigación, se le ha concedido la Mención de Calidad.
Asimismo, organizó, en el marco de los VI Cursos de Postgrado en Derecho en Enero de 2006, el Curso "El Control Tributario: potestades de la Administración y Derechos del Contribuyente". El Centro organiza, igualmente, diversas Jornadas y Seminarios Avanzados en materias propias del mismo, con regularidad y en los distintos campus de la Universidad de Castilla-La Mancha, lo que se ve facilitado por la dimensión regional del mismo, al contar con miembros en los cuatro campus. Entre ellos, puede citarse las "IV Jornadas sobre las Reformas Fiscales en Europa" en abril de 2006, cuya primera edición tuvo lugar en marzo de 2003).
Algunas de estas Jornadas y Seminarios, como ha sucedido en el pasado, se orientan a alumnos, otros a funcionarios y profesionales en ejercicio y otros a ambos grupos de destinatarios. Además de este tipo de Jornadas y Seminarios, el CIEF-EEAET impulsa los proyectos de Master, Doctorado y otros Cursos de Especialización, de dimensión europea, que promueve la Escuela Europea de Altos Estudios Tributarios.